La cultura Marajoara se desarrolló en las islas de la desembocadura del río Amazonas, especialmente en la Gran Isla de Marajó, frente a las costas de Brasil. Esta isla está formada en gran parte por extensas planicies con suelos poco aptos para la agricultura en un clima principalmente tropical.

En la época de apogeo de esta cultura, la Isla de Marajó era la ocupación humana más importante de todo el Amazonas, aunque no se sabe prácticamente nada sobre sus orígenes o sus descendientes. No obstante, aún hoy es posible ver sus influencias en ciertas poblaciones indígenas del interior, especialmente en los diseños de la cerámica del pueblo Shipibo Conibo que habita la parte alta del Amazonas.